Muhasebe entegrasyonu için uyumlu olarak geliştirilen ProjeShop V5, LOGO Go Muhasebe Yazılımı ile entegrasyon sağlamaktadır. Projeshop ile bu yazılımda stok, fiyat, sipariş, cari kar ve fatura entegrasyonu yapılmaktadır. Böylece e-ticaret sistemi ile haberleşen muhasebe yazılımı sayesinde sitede bulunan ürünlerin stokları, fiyatları güncellenirken siteye gelen siparişler aynı anda muhasebe yazılımına da girerek fatura muhasebe sisteminden hazırlanırken sipariş sitede güncellenir. Sistemlerin hepsinde hem doğru bilgi yer alır hem de bu bilgilerin kontrol edilmesi ile geçecek zamandan da tasarruf sağlanır.